La Villa de Pradejón se encuentra situada a una altura de 361 m. Sobre el nivel del mar. Limita al Norte con Montealto (474m.) y el río Ebro, al Sur con el ferrocarril de Calahorra, Arnedillo y los términos d Calahorra, Autol y Quel, al Este con Murillo de Calahorra y los términos de la Plana y Valroyuelo (ambos de Calahorra), y al Oeste con los términos de la Piñuela, Los Horcajos, Campo Viejo y Noceledón, ambos de la jurisdicción de El Villa de Arnedo y el término de Arnedo.
